传染病的病原检测与鉴别，需要收集患者的血样，经过一系列的试验，才能得到确切的病原诊断。样本的品质对诊断结果的正误有很大的影响，样本处理不得当会导致假阴性、假阳性结果的产生，所以在样本采集、送检、保存等过程中，必须对样本进行标准化处理，并对其进行严格的控制，这是保证实验结果准确性和可靠性的先决条件。
1血液标本
正常情况下，血液应该是经过消毒的。如果有病菌入侵，就会导致严重的菌血和败血。一般来说，病人在发烧开始或者达到最高温度的时候就可以进行抽血，如果是持续的菌血病，可以在任何时候都可以进行抽血，如果是间歇性的菌血病，则应该在体温上升的时候进行抽血。通常情况下，在服用抗生素之前，需要进行2~3次采集，并且要进行多个位置的采集，比如两边肘静脉或者动、静脉同时采集，如果已经服用了抗生素，不能停下来的话，可以在下一次服药之前进行。对病灶邻近的静脉进行抽血检查，可以提高检测的准确率。正常情况下，成年人需要采集5~10毫升的血液，孩子需要采集1~2毫升的血液。
2尿液标本
正常人群的尿液为无菌性尿液，而女性在经期易受污染，故不宜收集。尿液的采集方式主要有三种，一种是尿液采集法，一种是肾盂尿采集法，另一种是膀胱穿刺法。通过对尿中细菌的定量分析，对尿中的细菌进行了定量分析，以区分被污染细菌和致病菌。通常情况下，尿液中细菌数量大于105/ml就是病原菌，小于104/ml就是污染菌，怀疑是需要再次检查，如果再次检查还是相同的结果，就应该被认为是病原菌。与尿量、尿液在膀胱中停留的时间、是否有利尿剂等因素有关。
3脑脊液标本
正常情况下，脑脊液应该是无菌的。根据消毒程序，从腰间取3~5ml脑脊液样本，并及时送病理检查或在床头接种。运输时须在35℃下保温。化脓性脑膜炎的涂片是由于细菌导致的，通常情况下会出现浑浊，在使用抗生素后也会消失。还可以考虑无菌性脑膜炎、结核性脑膜炎等疾病。如果是不浑浊的，可以用3000r/min离心10~15min，然后取沉淀涂片染色进行检查。如果在中性粒细胞内和体外均存在革兰阴性凹陷双球菌，则是在胞内胞外发现革兰阴性双球菌，怀疑脑膜炎。如果在胞外胞外发现革兰阴性双球菌，则是在胞外胞外发现革兰阴性双球菌，怀疑肺炎链球菌。以全价抗血清作球囊肿大检测，阳性者则是球囊肿大检测阳性，如有其它形式的病原菌，可按形态学、着色性等进行检测。对于涂片呈阳性的样本，最好的方法是对样本进行直接药物敏感性测试。
4生殖道标本
用消毒棉签收集男性尿道和生殖器的脓液，放入消毒的试管内。在医生的帮助下，通过肛门对患者进行了前列腺的按摩，并抽取了前列腺的液体。从妇女的生殖道直接取自后穹隆部的排泄物。对于发生骨盆脓肿的病人，在对阴道进行灭菌处理后，通过后穹隆部穿刺抽出脓液。将两个插管插入宫腔，取宫内排泄物，将其溃疡底挤压出少量的组织液体，用干净的玻璃片直接浸泡，盖上玻璃片后送病理检查。涂片检查：普通细菌及淋球菌可用革兰染色，梅毒螺旋体可用暗视野显微镜或镀银染色，结核分枝杆菌可用抗酸染色。
5脓液、胸腹水及分泌物等其它标本
对于封闭性脓肿，如果怀疑感染了厌氧菌，应该马上把注射器里的空气抽干，把针插进橡胶塞里，然后把开放的脓肿或者瘘管从深层取出样本。采用革兰氏染色法对样本进行涂片法检查，如有病原菌，则将病原菌直接报告，并将病原菌接种于血板上进行培养。胸腹水经胸部或腹部穿刺后，置入无菌管，送病理检查。
综上所述，如果不能正确地收集到临床微生物样本，将会对实验结果产生很大的影响，因此，希望医务人员能够对微生物样本的收集给予足够的关注，并严格按照标准的操作程序进行，以保证实验结果的误差降到最低，从而提高我国微生物事业的发展水平。
